Алгоритм ИТМО для поиска антибиотиков выявил 56 молекул-кандидатов

Краткое изложение публикации в сообществе «Фарма РФ» от .

Ученые Университета ИТМО разработали алгоритм машинного обучения для поиска молекул-кандидатов в антибиотики, способные связываться с белками ДНК-гираза А и В. Эти белки связаны с размножением и выживанием грамотрицательных бактерий. Алгоритм сгенерировал 56 соединений на основе бензимидазола; точность встроенной модели прогнозирования активности составила 81% на тестовых образцах известных соединений.

Вычислительная проверка методом пертурбации свободной энергии выявила два соединения с активностью выше, чем у зарегистрированного антибиотика новобиоцина. Лабораторные испытания молекул еще предстоят. В дальнейшем алгоритм можно перенастроить для поиска лекарств против других бактерий, вирусов и грибков.

Главное

  • Алгоритм предназначен для поиска молекул, активных в отношении белков ДНК-гираза А и В.
  • Сгенерированы 56 соединений на основе бензимидазола.
  • Два соединения показали при вычислительной проверке активность выше, чем у новобиоцина.
  • Точность модели прогнозирования активности составила 81% на тестовых образцах известных соединений.

Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только специалистам фармацевтической отрасли.

Регистрация

По теме